5作目：『名探偵コナン 天国へのカウントダウン』（2001年公開）

【あらすじ】
富士山が一望できる、西多摩市のツインタワービル・スイートルームで殺人事件が発生する。殺されたのは市議会議員・大木岩松。傍らには2つに割られた猪口が残されていた。一方、黒ずくめの組織と灰原の怪しい動きに気づいたコナンは、この事件に黒ずくめの組織が関わっているのではないかと警戒を強める。そんな中、ツインタワービルで開かれるパーティーにコナンや少年探偵団も招待される。しかし会場では更なる殺人、そして、ビルの中階で謎の爆発が発生し…。

公開日	2001年4月21日
主題歌	倉木麻衣「always」

4作目：『名探偵コナン 瞳の中の暗殺者』（2000年公開）

【あらすじ】
警察官を狙った連続殺人事件が発生。現場を目撃したコナンは、必死の追跡も虚しく、犯人を取り逃してしまっていた。さらに、事件について聞き出そうとするも、白鳥刑事には「Need not to know（知る必要のないこと）」と言い放たれてしまう。そんな中、警察関係者が多く集まるパーティで佐藤刑事が襲われ、居合わせた蘭がショックで記憶喪失に！ 犯人の顔を目撃したため、命を狙われる蘭。何もかも忘れてしまった蘭を、コナンは守り切れるのか!?

公開日	2000年4月22日
主題歌	小松未歩「あなたがいるから」

3作目：『名探偵コナン 世紀末の魔術師』（1999年公開）

【あらすじ】
世間を騒がす大怪盗“怪盗キッド”から、鈴木財閥が所有するロマノフ王朝の遺産"インペリアル・イースター・エッグ"を盗むという予告状が届く。大阪に駆けつけたコナンは服部平次と合流。そこへ颯爽と現れたキッドがエッグを盗み出すが、逃走中、何者かに狙撃されキッドは行方不明に。再びコナンたちのもとに戻ったエッグの謎を追い、豪華客船で神奈川に向かったコナン一行だったが、その船内で殺人事件が発生する！

公開日	1999年4月17日
主題歌	B'z「ONE」

2作目：『名探偵コナン 14番目の標的（ターゲット）』（1998年公開）

【あらすじ】
目暮警部、蘭の母で弁護士の妃英理、阿笠博士が何者かに命を狙われた。小五郎と親しい人物が標的にされたことから、犯人は小五郎に恨みをもつ者と思われるが……？ 一方、コナンは現場の遺留品がトランプの絵札に関連していることに気づき、襲われた3人の名前にある共通点を見つけた。"八"の字をもつ小五郎の旧友で、ソムリエの沢木公平を護衛するため、海洋娯楽施設"アクアクリスタル"に向かったコナンたちは、名前に数字をもつ4人の人物に出会う。

公開日	1998年4月18日
主題歌	ZARD「少女の頃に戻ったみたいに」

1作目：『名探偵コナン 時計じかけの摩天楼』（1997年）

【あらすじ】
新一の誕生日の前日、何者かにプラスチック爆弾用の火薬が大量に盗まれ、コナンたちが殺人事件を解決したばかりの黒川邸が放火された。ニュースに驚くコナンだったが、そこに犯人を名乗る男から予告電話が！ 狙われたのは子供たちが集まる緑地公園。現場に駆けつけたコナンは爆弾から無事に子供たちを守るが、犯人から次なる爆破予告が届き…。犯人は新一に恨みをもつ者なのか？ パニックに陥った大都会、そしてタイムリミットが迫る！

公開日	1997年4月19日
主題歌	杏子「Happy Birthday」

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